Q：circRNA 芯片實(shí)驗(yàn)的起始量是多少？
A：
Q：circRNA 芯片是如何做到能有效檢測 circRNA 而非其母基因的？
A：circRNA 芯片主要基于 circBase 數(shù)據(jù)庫，我們?cè)谠O(shè)計(jì)的時(shí)候針對(duì) circRNA 的反向剪切位點(diǎn)進(jìn)行探針設(shè)計(jì)，保證每個(gè)探針能特異性能檢測 circRNA，從而避免與母基因之間的冗余影響。
Q：circRNA 芯片適用于哪些物種？
A：目前我們有三款 SBC circRNA 芯片，可以用于檢測人、小鼠和大鼠的 circRNA 表達(dá)情況。
Q：circRNA 芯片的 circRNA 信息來源于哪些數(shù)據(jù)庫？
A：SBCcircRNA 芯片的 circRNA 信息主要來源于 circBase 數(shù)據(jù)庫，其中小鼠 circRNA 芯片包含了部分 SBC 測序來源的 circRNA，豐富了小鼠 circRNA 芯片的 circRNA 信息。
Q：伯豪客戶利用 circRNA 芯片發(fā)表了哪些文章？
A：伯豪做 circRNA 芯片的客戶相對(duì)較少，一般會(huì)選擇 ceRNA 芯片，因?yàn)?ceRNA 芯片除包含了 circRNA 芯片里面所有的信息外，還包含了 lncRNA 的信息，因此一般客戶相對(duì)來說會(huì)選擇信價(jià)比更高的 ceRNA 芯片。利用 circRNA 芯片發(fā)表的文章詳見附件 【查看 】。
Q：circRNA 定量驗(yàn)證時(shí)，引物設(shè)計(jì)基于哪段序列？
A：由于 circRNA 特殊的環(huán)化結(jié)構(gòu)，且與母基因具有相同的序列信息，在設(shè)計(jì) RT-qPCR 引物時(shí)，我們建議將上下游引物設(shè)計(jì)在反向剪切位點(diǎn)的兩側(cè)，且產(chǎn)物應(yīng)包含反向剪切位點(diǎn)，如此能夠有效檢測 circRNA 的表達(dá)量，避免 circRNA 母基因的冗余影響。具體詳見附件 【查看】。
Q：有哪些數(shù)據(jù)庫可用于查詢 circRNA 信息？
A：有很多在線數(shù)據(jù)庫可供參考，具體可以分為兩大類：信息查詢數(shù)據(jù)庫和功能研究數(shù)據(jù)庫。
（1）信息查詢數(shù)據(jù)庫：circBase、CIRCpedia；
（2）功能研究數(shù)據(jù)庫，可進(jìn)行 ceRNA 分析，蛋白編碼預(yù)測，RNA 結(jié)合蛋白預(yù)測等：circRNADb、starBase、deepBase、circ2Traits、circNet、Circular RNA Interactome。
Q：circRNA 有哪些研究方向？
A：circRNA 研究可分為 biomarker 研究和分子機(jī)制研究兩個(gè)不同的方向。
由于 circRNA 表達(dá)穩(wěn)定、不易降解 、具有組織特異性、疾病特異性等特點(diǎn)，且血液中有豐富的表達(dá)， 因此使得 circRNA 成為理想的 Biomarker。
circRNA 分子機(jī)制的研究與 lncRNA 類似， circRNA 可作為 miRNA 的海綿吸附體影響 miRNA 對(duì)其下游靶基因的表達(dá)調(diào)控；circRNA 調(diào)控母基因的轉(zhuǎn)錄等生物學(xué)功能。此外，circRNA 翻譯成蛋白進(jìn)而調(diào)控細(xì)胞功能也是一個(gè)新的方向。
Q：如何預(yù)測 circRNA 的生物學(xué)功能？
A：circRNA 的研究尚處于初級(jí)階段，很多功能還有待于進(jìn)一步研究，目前對(duì) circRNA 功能的預(yù)測主要有兩種方法：
（1）通過對(duì) circRNA 母基因的功能分析來推測 circRNA 的功能，該功能預(yù)測主要基于 circRNA 調(diào)控母基因的原則；
（2）通過 ceRNA 機(jī)制分析找到潛在的 circRNA-miRNA-mRNA 調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，以 mRNA 的功能推測 circRNA 的潛在生物學(xué)功能，該功能預(yù)測基于 ceRNA 機(jī)制。
