lncRNA

在之前的分享中小編給大家介紹過非編碼 RNA 家族中的 circRNA , 如果說 circRNA 是目前生物學研究領域的流量擔當，那 lncRNA 應是紅遍大江南北了。從 lncRNA 歷年文獻發表情況和近十年國自然相關項目數據可以看出，lncRNA  在科研領域中熱度年年攀升，并且高熱不減。lncRNA  可以通過影響染色質結構和轉錄因子占位、表觀遺傳學、以序列和結構特異性結合生物大分子等機制調節基因表達，在發育、機體內平衡和維持細胞命運中發揮重要作用，lncRNA  的異常表達與包括癌癥在內的多種疾病密切相關。隨著高通量測序、lncRNA  芯片等技術的發展，越來越多的  lncRNA  被鑒定出來，但具體的作用與功能仍然不是很清楚，因此 lncRNA  的研究前景依然是十分廣闊的，具有極大的研究價值。今天就與大家分享兩篇新鮮出爐的 lncRNA 研究。

lncRNA 歷年文獻發表情況

近十年國自然 lncRNA 相關項目數據

文章展示

長非編碼 RNA PGM5-AS1 通過削弱 miR-140-5p 介導的 FBN1 抑制，促進骨肉瘤細胞的上皮 - 間質轉化，侵襲和轉移

Long non-coding RNA PGM5-AS1 promotes epithelial-mesenchymal transition, invasion and metastasis of osteosarcoma cells by impairing miR-140-5p-mediated FBN1 inhibition

期刊：Mol Oncol

發表時間：2020 May 15

影響因子：5.962

單位：吉林省第一醫院

摘要：骨肉瘤是一種罕見的骨腫瘤，近年來發病率升高，愈合率低；上皮 - 間質轉化（EMT）是解釋骨肉瘤和其他癌癥的侵襲和轉移的概念范例。因此，制定有效的治療策略來治療骨肉瘤的 EMT 是至關重要的。研究確定了長非編碼 RNA（lncRNA）PGM5-AS1 在 EMT 和骨肉瘤進展中的分子機制；基于微陣列的分析用于篩選骨肉瘤相關的差異表達的 lncRNA；測定骨肉瘤組織和細胞中 PGM5-AS1 以及 microRNA-140-5p（miR-140-5p）和原纖維蛋白 -1（FBN1）的水平；熒光素報告系統確認結合片段，RNA  pull-down 實驗和 RNA 蛋白免疫沉淀實驗以驗證 PGM5-AS1，miR-140-5p 和 FBN1 之間的關系。通過過表達、shRNA、模擬物或抑制劑改變 PGM5-AS1、miR-140-5p 和 FBN1 的表達，以探討它們在體外如何調節骨肉瘤細胞的轉移、侵襲和 EMT。在裸鼠體內采用功能喪失和功能增強的方法檢測它們在體內腫瘤發生中的作用，發現骨肉瘤組織和細胞表達較低，但 PGM5-AS1 和 FBN1 表達較高；PGM5-AS1 與 miR-140-5p 競爭性結合以上調 FBN1。此外，阻礙 PGM5-AS1 和 FBN1 或過表達 miR-140-5p 在體外抑制骨肉瘤細胞的轉移，侵襲和 EMT。此外，沉默 PGM5-AS1 或 FBN1 或過表達 miR-140-5p 顯著抑制裸鼠體內的腫瘤發生。綜上所述，PGM5-AS1 消耗導致 FBN1 減少，通過負調節 miR-140-5p 來延緩骨肉瘤過程。

PGM5-AS1 在骨肉瘤細胞過程中的調節機制

SMAD4 激活 Wnt 信號通路抑制顆粒細胞凋亡

SMAD4 activates Wnt signaling pathway to inhibit granulosa cell apoptosis

期刊：Cell Death & Disease

發表時間：2020 May 15

影響因子：5.595

單位：南京農業大學

摘要：TGF- β 和 Wnt 信號通路在許多細胞類型和組織中相互關聯，并協調控制細胞功能。這篇文章中，報道了 TGF- β 信號通路的下游效應因子 SMAD4 誘導 Wnt 信號通路的受體 FZD4，建立了顆粒細胞（GCs) 中這兩條通路之間的新的途徑。研究者發現 SMAD4 是 FZD4 的強誘導劑，不僅啟動 FZD4 轉錄，而且激活 FZD4 依賴的 Wnt 信號和 GC 凋亡。研究者確定了 SMAD4 促進 GC 中 FZD4 表達的直接和間接機制；SMAD4 促進 SDNOR 的產生，SDNOR 是一種新的 lncRNA，作為 miR-29c 的海綿，提供了另一種阻止 miR-29c 退化 FZD4mRNA 的手段。該研究不僅揭示了 TGF- β 和 Wnt 信號通路 SMAD4-FZD4 軸之間的一個新的串擾通道，而且為 GC 凋亡和卵泡閉鎖的調控網絡提供了新的見解：這些 RNA 分子，如 miR-29c 和 lnc-SDNOR，是治療生殖疾病和提高女性生育能力的潛在靶點。

SMAD4 保護 FZD4 的原理模型

研究思路

前期高通量和數據分析，后期功能分子實驗檢驗（敲除過表達、熒光素酶報告系統、染色質免疫沉淀等）。

lncRNA 機制研究如何 get 高分

lncRNA 的機制研究相當困難，主要實驗過程復雜，實驗量巨大，如果想發超 10 分的高分文章并且有好的研究思路可以從這個角度探索。其實我們可以換個角度研究 lncRNA，不要將 lncRNA 作為一個調節分子；而是把 lncRNA 當做和 mRNA 一樣的分子來研究。在體外，可以通過分子干擾手段，進行分子及表型研究；在體內，也是如此。兩者通過各種組合，也能輕松 get 一篇 5 分以上的文章。

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